Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms