Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lin28aQ8K3Y3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lin28aQ8K3Y3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lin28aQ8K3Y3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lin28aQ8K3Y3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lin28aQ8K3Y3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lin28aQ8K3Y3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lin28aQ8K3Y3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lin28aQ8K3Y3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lin28aQ8K3Y3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lin28aQ8K3Y3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lin28aQ8K3Y3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lin28aQ8K3Y3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lin28aQ8K3Y3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lin28aQ8K3Y3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lin28aQ8K3Y3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lin28aQ8K3Y3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lin28aQ8K3Y3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lin28aQ8K3Y3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lin28aQ8K3Y3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lin28aQ8K3Y3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lin28aQ8K3Y3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lin28aQ8K3Y3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lin28aQ8K3Y3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lin28aQ8K3Y3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lin28aQ8K3Y3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms