Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Paf1Q8K2T8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Paf1Q8K2T8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Paf1Q8K2T8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms