Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brd3Q8K2F0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms