Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Neil3Q8K203 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neil3Q8K203 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms