Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkd3Q8K1Y2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms