Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFF0

Parp11, Poly [ADP-ribose] polymerase 11, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp11Q8CFF0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Parp11Q8CFF0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.6 ms