Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ercc8Q8CFD5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ercc8Q8CFD5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ercc8Q8CFD5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ercc8Q8CFD5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc8Q8CFD5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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