Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCB4

Vps53, Vacuolar protein sorting-associated protein 53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps53Q8CCB4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps53Q8CCB4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms