Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAS9

Parp9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, mousemouse

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Length 866 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp9Q8CAS9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Parp9Q8CAS9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Parp9Q8CAS9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Parp9Q8CAS9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Parp9Q8CAS9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Parp9Q8CAS9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Parp9Q8CAS9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Parp9Q8CAS9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp9Q8CAS9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp9Q8CAS9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp9Q8CAS9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp9Q8CAS9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp9Q8CAS9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp9Q8CAS9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp9Q8CAS9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp9Q8CAS9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp9Q8CAS9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp9Q8CAS9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Parp9Q8CAS9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Parp9Q8CAS9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Parp9Q8CAS9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Parp9Q8CAS9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Parp9Q8CAS9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Parp9Q8CAS9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Parp9Q8CAS9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Parp9Q8CAS9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Parp9Q8CAS9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Parp9Q8CAS9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Parp9Q8CAS9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms