Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc90bQ8C3X2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc90bQ8C3X2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms