Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube3dQ8BX13 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube3dQ8BX13 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube3dQ8BX13 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube3dQ8BX13 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube3dQ8BX13 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube3dQ8BX13 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube3dQ8BX13 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube3dQ8BX13 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube3dQ8BX13 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube3dQ8BX13 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube3dQ8BX13 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube3dQ8BX13 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube3dQ8BX13 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube3dQ8BX13 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube3dQ8BX13 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms