Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx17Q8BVL3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx17Q8BVL3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms