Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp4f39Q8BGU0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp4f39Q8BGU0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms