Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem39bQ810L4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmem39bQ810L4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem39bQ810L4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem39bQ810L4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem39bQ810L4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem39bQ810L4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem39bQ810L4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem39bQ810L4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem39bQ810L4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem39bQ810L4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem39bQ810L4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem39bQ810L4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem39bQ810L4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem39bQ810L4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem39bQ810L4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem39bQ810L4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem39bQ810L4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem39bQ810L4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem39bQ810L4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem39bQ810L4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem39bQ810L4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem39bQ810L4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem39bQ810L4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem39bQ810L4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem39bQ810L4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem39bQ810L4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem39bQ810L4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms