Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim19Q80ZU4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim19Q80ZU4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim19Q80ZU4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim19Q80ZU4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim19Q80ZU4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim19Q80ZU4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim19Q80ZU4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim19Q80ZU4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim19Q80ZU4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim19Q80ZU4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim19Q80ZU4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms