Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc27Q80YS5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrc27Q80YS5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrc27Q80YS5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrc27Q80YS5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrc27Q80YS5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrc27Q80YS5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrc27Q80YS5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrc27Q80YS5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc27Q80YS5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc27Q80YS5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc27Q80YS5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc27Q80YS5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc27Q80YS5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc27Q80YS5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc27Q80YS5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc27Q80YS5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc27Q80YS5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc27Q80YS5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc27Q80YS5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc27Q80YS5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc27Q80YS5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc27Q80YS5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc27Q80YS5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc27Q80YS5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc27Q80YS5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc27Q80YS5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc27Q80YS5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc27Q80YS5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc27Q80YS5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc27Q80YS5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc27Q80YS5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc27Q80YS5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc27Q80YS5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc27Q80YS5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc27Q80YS5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc27Q80YS5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc27Q80YS5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms