Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Uhrf2Q7TMI3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uhrf2Q7TMI3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uhrf2Q7TMI3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uhrf2Q7TMI3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Uhrf2Q7TMI3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uhrf2Q7TMI3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uhrf2Q7TMI3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uhrf2Q7TMI3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uhrf2Q7TMI3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uhrf2Q7TMI3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uhrf2Q7TMI3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uhrf2Q7TMI3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uhrf2Q7TMI3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uhrf2Q7TMI3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uhrf2Q7TMI3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uhrf2Q7TMI3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uhrf2Q7TMI3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Uhrf2Q7TMI3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uhrf2Q7TMI3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uhrf2Q7TMI3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uhrf2Q7TMI3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uhrf2Q7TMI3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uhrf2Q7TMI3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uhrf2Q7TMI3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uhrf2Q7TMI3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uhrf2Q7TMI3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uhrf2Q7TMI3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uhrf2Q7TMI3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uhrf2Q7TMI3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uhrf2Q7TMI3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uhrf2Q7TMI3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms