Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim12Q78RX3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms