Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snd1Q78PY7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snd1Q78PY7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms