Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RfflQ6ZQM0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RfflQ6ZQM0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms