Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NinlQ6ZQ12 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NinlQ6ZQ12 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NinlQ6ZQ12 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NinlQ6ZQ12 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NinlQ6ZQ12 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NinlQ6ZQ12 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NinlQ6ZQ12 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NinlQ6ZQ12 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NinlQ6ZQ12 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NinlQ6ZQ12 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NinlQ6ZQ12 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NinlQ6ZQ12 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NinlQ6ZQ12 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NinlQ6ZQ12 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NinlQ6ZQ12 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NinlQ6ZQ12 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NinlQ6ZQ12 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NinlQ6ZQ12 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NinlQ6ZQ12 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NinlQ6ZQ12 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NinlQ6ZQ12 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NinlQ6ZQ12 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NinlQ6ZQ12 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NinlQ6ZQ12 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NinlQ6ZQ12 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NinlQ6ZQ12 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NinlQ6ZQ12 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NinlQ6ZQ12 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NinlQ6ZQ12 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NinlQ6ZQ12 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NinlQ6ZQ12 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NinlQ6ZQ12 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NinlQ6ZQ12 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NinlQ6ZQ12 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NinlQ6ZQ12 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NinlQ6ZQ12 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NinlQ6ZQ12 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NinlQ6ZQ12 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NinlQ6ZQ12 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NinlQ6ZQ12 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NinlQ6ZQ12 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NinlQ6ZQ12 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NinlQ6ZQ12 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NinlQ6ZQ12 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NinlQ6ZQ12 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NinlQ6ZQ12 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NinlQ6ZQ12 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NinlQ6ZQ12 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NinlQ6ZQ12 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NinlQ6ZQ12 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NinlQ6ZQ12 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NinlQ6ZQ12 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NinlQ6ZQ12 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NinlQ6ZQ12 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NinlQ6ZQ12 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
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