Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tfap2eQ6VUP9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tfap2eQ6VUP9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tfap2eQ6VUP9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tfap2eQ6VUP9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tfap2eQ6VUP9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tfap2eQ6VUP9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tfap2eQ6VUP9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tfap2eQ6VUP9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tfap2eQ6VUP9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tfap2eQ6VUP9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tfap2eQ6VUP9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tfap2eQ6VUP9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tfap2eQ6VUP9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tfap2eQ6VUP9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tfap2eQ6VUP9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tfap2eQ6VUP9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tfap2eQ6VUP9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tfap2eQ6VUP9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms