Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q477

Atp2b4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b4Q6Q477 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp2b4Q6Q477 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Atp2b4Q6Q477 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp2b4Q6Q477 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp2b4Q6Q477 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp2b4Q6Q477 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp2b4Q6Q477 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp2b4Q6Q477 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp2b4Q6Q477 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp2b4Q6Q477 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp2b4Q6Q477 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp2b4Q6Q477 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp2b4Q6Q477 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp2b4Q6Q477 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp2b4Q6Q477 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp2b4Q6Q477 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp2b4Q6Q477 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp2b4Q6Q477 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp2b4Q6Q477 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp2b4Q6Q477 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp2b4Q6Q477 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms