Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ8

Kcnip4, Kv channel-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip4Q6PHZ8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnip4Q6PHZ8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms