Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gramd2bQ6PEM6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms