Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SvoplQ6PDF3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms