Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8I4

Pcnp, PEST proteolytic signal-containing nuclear protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnpQ6P8I4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PcnpQ6P8I4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PcnpQ6P8I4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PcnpQ6P8I4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PcnpQ6P8I4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PcnpQ6P8I4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PcnpQ6P8I4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PcnpQ6P8I4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PcnpQ6P8I4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PcnpQ6P8I4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PcnpQ6P8I4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PcnpQ6P8I4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PcnpQ6P8I4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PcnpQ6P8I4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PcnpQ6P8I4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PcnpQ6P8I4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcnpQ6P8I4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms