Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc148Q6P5U8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc148Q6P5U8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc148Q6P5U8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc148Q6P5U8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc148Q6P5U8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc148Q6P5U8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc148Q6P5U8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc148Q6P5U8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc148Q6P5U8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc148Q6P5U8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc148Q6P5U8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc148Q6P5U8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms