Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CDC42EP5Q6NZY7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDC42EP5Q6NZY7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms