Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOBEC3HQ6NTF7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOBEC3HQ6NTF7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms