Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tpm4Q6IRU2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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