Protein–RNA interactions for Protein: Q6A009

Ltn1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, mousemouse

Predictions only

Length 1,767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltn1Q6A009 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ltn1Q6A009 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ltn1Q6A009 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ltn1Q6A009 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ltn1Q6A009 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ltn1Q6A009 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ltn1Q6A009 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ltn1Q6A009 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ltn1Q6A009 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ltn1Q6A009 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ltn1Q6A009 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ltn1Q6A009 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ltn1Q6A009 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ltn1Q6A009 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ltn1Q6A009 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ltn1Q6A009 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ltn1Q6A009 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ltn1Q6A009 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ltn1Q6A009 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ltn1Q6A009 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ltn1Q6A009 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ltn1Q6A009 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ltn1Q6A009 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ltn1Q6A009 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ltn1Q6A009 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ltn1Q6A009 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ltn1Q6A009 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ltn1Q6A009 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ltn1Q6A009 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ltn1Q6A009 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ltn1Q6A009 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ltn1Q6A009 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ltn1Q6A009 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ltn1Q6A009 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ltn1Q6A009 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ltn1Q6A009 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ltn1Q6A009 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ltn1Q6A009 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ltn1Q6A009 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ltn1Q6A009 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ltn1Q6A009 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ltn1Q6A009 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ltn1Q6A009 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ltn1Q6A009 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ltn1Q6A009 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ltn1Q6A009 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ltn1Q6A009 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ltn1Q6A009 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ltn1Q6A009 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ltn1Q6A009 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms