Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdk13Q69ZA1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdk13Q69ZA1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdk13Q69ZA1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdk13Q69ZA1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Cdk13Q69ZA1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Cdk13Q69ZA1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Cdk13Q69ZA1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdk13Q69ZA1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdk13Q69ZA1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdk13Q69ZA1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdk13Q69ZA1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdk13Q69ZA1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdk13Q69ZA1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdk13Q69ZA1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdk13Q69ZA1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdk13Q69ZA1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdk13Q69ZA1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdk13Q69ZA1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdk13Q69ZA1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdk13Q69ZA1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdk13Q69ZA1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdk13Q69ZA1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdk13Q69ZA1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdk13Q69ZA1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdk13Q69ZA1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdk13Q69ZA1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdk13Q69ZA1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdk13Q69ZA1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdk13Q69ZA1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdk13Q69ZA1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdk13Q69ZA1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdk13Q69ZA1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdk13Q69ZA1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdk13Q69ZA1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdk13Q69ZA1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdk13Q69ZA1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdk13Q69ZA1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdk13Q69ZA1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdk13Q69ZA1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdk13Q69ZA1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdk13Q69ZA1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Cdk13Q69ZA1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Cdk13Q69ZA1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms