Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf280dQ68FE8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Znf280dQ68FE8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf280dQ68FE8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf280dQ68FE8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf280dQ68FE8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf280dQ68FE8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf280dQ68FE8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf280dQ68FE8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf280dQ68FE8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Znf280dQ68FE8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf280dQ68FE8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Znf280dQ68FE8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Znf280dQ68FE8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Znf280dQ68FE8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf280dQ68FE8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms