Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pan3Q640Q5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pan3Q640Q5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.9 ms