Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Zfp248Q640N4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Zfp248Q640N4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Zfp248Q640N4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zfp248Q640N4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Zfp248Q640N4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zfp248Q640N4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zfp248Q640N4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Zfp248Q640N4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Zfp248Q640N4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Zfp248Q640N4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Zfp248Q640N4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zfp248Q640N4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zfp248Q640N4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zfp248Q640N4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zfp248Q640N4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zfp248Q640N4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Zfp248Q640N4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Zfp248Q640N4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Zfp248Q640N4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Zfp248Q640N4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Zfp248Q640N4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Zfp248Q640N4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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