Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ccdc18Q640L5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ccdc18Q640L5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Ccdc18Q640L5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ccdc18Q640L5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ccdc18Q640L5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ccdc18Q640L5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ccdc18Q640L5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ccdc18Q640L5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ccdc18Q640L5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ccdc18Q640L5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ccdc18Q640L5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ccdc18Q640L5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ccdc18Q640L5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ccdc18Q640L5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ccdc18Q640L5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ccdc18Q640L5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ccdc18Q640L5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ccdc18Q640L5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ccdc18Q640L5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ccdc18Q640L5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ccdc18Q640L5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ccdc18Q640L5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ccdc18Q640L5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ccdc18Q640L5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ccdc18Q640L5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ccdc18Q640L5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ccdc18Q640L5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ccdc18Q640L5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ccdc18Q640L5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ccdc18Q640L5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ccdc18Q640L5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ccdc18Q640L5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ccdc18Q640L5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccdc18Q640L5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccdc18Q640L5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccdc18Q640L5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccdc18Q640L5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccdc18Q640L5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccdc18Q640L5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccdc18Q640L5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccdc18Q640L5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccdc18Q640L5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ccdc18Q640L5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Ccdc18Q640L5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ccdc18Q640L5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ccdc18Q640L5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ccdc18Q640L5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ccdc18Q640L5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ccdc18Q640L5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ccdc18Q640L5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ccdc18Q640L5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ccdc18Q640L5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ccdc18Q640L5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ccdc18Q640L5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ccdc18Q640L5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Ccdc18Q640L5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ccdc18Q640L5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ccdc18Q640L5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ccdc18Q640L5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ccdc18Q640L5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Ccdc18Q640L5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ccdc18Q640L5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ccdc18Q640L5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ccdc18Q640L5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ccdc18Q640L5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ccdc18Q640L5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Ccdc18Q640L5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Ccdc18Q640L5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Ccdc18Q640L5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ccdc18Q640L5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ccdc18Q640L5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ccdc18Q640L5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ccdc18Q640L5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ccdc18Q640L5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ccdc18Q640L5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Ccdc18Q640L5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ccdc18Q640L5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ccdc18Q640L5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ccdc18Q640L5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ccdc18Q640L5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ccdc18Q640L5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Ccdc18Q640L5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ccdc18Q640L5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ccdc18Q640L5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ccdc18Q640L5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
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