Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Col4a5Q63ZW6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms