Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vat1Q62465 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms