Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp1Q62442 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vamp1Q62442 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms