Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpd52Q62393 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tpd52Q62393 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tpd52Q62393 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpd52Q62393 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpd52Q62393 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpd52Q62393 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpd52Q62393 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpd52Q62393 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpd52Q62393 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpd52Q62393 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpd52Q62393 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tpd52Q62393 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpd52Q62393 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tpd52Q62393 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpd52Q62393 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpd52Q62393 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpd52Q62393 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpd52Q62393 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpd52Q62393 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpd52Q62393 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpd52Q62393 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpd52Q62393 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpd52Q62393 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpd52Q62393 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpd52Q62393 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpd52Q62393 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpd52Q62393 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms