Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox19Q62249 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox19Q62249 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox19Q62249 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox19Q62249 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox19Q62249 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox19Q62249 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox19Q62249 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox19Q62249 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox19Q62249 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox19Q62249 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox19Q62249 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox19Q62249 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox19Q62249 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox19Q62249 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox19Q62249 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox19Q62249 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox19Q62249 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox19Q62249 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox19Q62249 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox19Q62249 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox19Q62249 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox19Q62249 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox19Q62249 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox19Q62249 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox19Q62249 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox19Q62249 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox19Q62249 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms