Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Kdm5dQ62240 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Kdm5dQ62240 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
Kdm5dQ62240 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
Kdm5dQ62240 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Kdm5dQ62240 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Kdm5dQ62240 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Kdm5dQ62240 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Kdm5dQ62240 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Kdm5dQ62240 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Kdm5dQ62240 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Kdm5dQ62240 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
Kdm5dQ62240 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Kdm5dQ62240 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Kdm5dQ62240 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Kdm5dQ62240 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Kdm5dQ62240 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Kdm5dQ62240 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Kdm5dQ62240 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Kdm5dQ62240 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Kdm5dQ62240 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Kdm5dQ62240 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Kdm5dQ62240 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Kdm5dQ62240 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Kdm5dQ62240 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Kdm5dQ62240 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Kdm5dQ62240 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Kdm5dQ62240 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Kdm5dQ62240 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Kdm5dQ62240 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Kdm5dQ62240 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Kdm5dQ62240 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Kdm5dQ62240 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Kdm5dQ62240 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Kdm5dQ62240 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Kdm5dQ62240 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Kdm5dQ62240 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Kdm5dQ62240 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Kdm5dQ62240 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Kdm5dQ62240 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Kdm5dQ62240 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Kdm5dQ62240 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Kdm5dQ62240 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Kdm5dQ62240 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Kdm5dQ62240 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Kdm5dQ62240 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Kdm5dQ62240 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Kdm5dQ62240 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Kdm5dQ62240 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Kdm5dQ62240 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Kdm5dQ62240 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Kdm5dQ62240 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Kdm5dQ62240 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Kdm5dQ62240 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Kdm5dQ62240 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Kdm5dQ62240 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Kdm5dQ62240 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Kdm5dQ62240 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Kdm5dQ62240 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Kdm5dQ62240 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Kdm5dQ62240 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Kdm5dQ62240 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Kdm5dQ62240 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Kdm5dQ62240 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Kdm5dQ62240 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Kdm5dQ62240 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.61
Kdm5dQ62240 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Kdm5dQ62240 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Kdm5dQ62240 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
Kdm5dQ62240 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Kdm5dQ62240 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Kdm5dQ62240 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Kdm5dQ62240 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Kdm5dQ62240 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Kdm5dQ62240 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Kdm5dQ62240 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Kdm5dQ62240 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Kdm5dQ62240 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Kdm5dQ62240 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Kdm5dQ62240 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Kdm5dQ62240 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Kdm5dQ62240 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Kdm5dQ62240 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Kdm5dQ62240 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Kdm5dQ62240 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Kdm5dQ62240 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Kdm5dQ62240 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Kdm5dQ62240 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
Kdm5dQ62240 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
Kdm5dQ62240 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Kdm5dQ62240 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Kdm5dQ62240 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Kdm5dQ62240 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Kdm5dQ62240 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Kdm5dQ62240 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Kdm5dQ62240 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Kdm5dQ62240 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Kdm5dQ62240 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.59
Kdm5dQ62240 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Kdm5dQ62240 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms