Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema3bQ62177 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema3bQ62177 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema3bQ62177 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema3bQ62177 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema3bQ62177 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema3bQ62177 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema3bQ62177 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema3bQ62177 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema3bQ62177 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema3bQ62177 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema3bQ62177 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema3bQ62177 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema3bQ62177 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema3bQ62177 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema3bQ62177 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema3bQ62177 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema3bQ62177 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema3bQ62177 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema3bQ62177 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema3bQ62177 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema3bQ62177 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema3bQ62177 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema3bQ62177 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema3bQ62177 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema3bQ62177 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema3bQ62177 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema3bQ62177 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema3bQ62177 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema3bQ62177 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema3bQ62177 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema3bQ62177 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema3bQ62177 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema3bQ62177 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema3bQ62177 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema3bQ62177 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema3bQ62177 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema3bQ62177 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema3bQ62177 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sema3bQ62177 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sema3bQ62177 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms