Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SspnQ62147 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SspnQ62147 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SspnQ62147 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SspnQ62147 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SspnQ62147 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SspnQ62147 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SspnQ62147 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SspnQ62147 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SspnQ62147 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SspnQ62147 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SspnQ62147 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SspnQ62147 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SspnQ62147 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SspnQ62147 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SspnQ62147 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SspnQ62147 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SspnQ62147 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SspnQ62147 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SspnQ62147 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SspnQ62147 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SspnQ62147 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SspnQ62147 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SspnQ62147 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SspnQ62147 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SspnQ62147 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SspnQ62147 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SspnQ62147 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SspnQ62147 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SspnQ62147 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SspnQ62147 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SspnQ62147 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SspnQ62147 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SspnQ62147 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SspnQ62147 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SspnQ62147 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SspnQ62147 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SspnQ62147 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SspnQ62147 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SspnQ62147 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SspnQ62147 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SspnQ62147 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SspnQ62147 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SspnQ62147 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SspnQ62147 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SspnQ62147 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SspnQ62147 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SspnQ62147 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SspnQ62147 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms