Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ecm1Q61508 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ecm1Q61508 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms