Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Irf9Q61179 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms