Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamb3Q61087 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms