Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NinQ61043 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NinQ61043 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NinQ61043 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NinQ61043 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NinQ61043 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NinQ61043 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NinQ61043 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NinQ61043 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NinQ61043 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NinQ61043 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NinQ61043 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NinQ61043 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NinQ61043 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NinQ61043 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NinQ61043 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NinQ61043 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NinQ61043 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NinQ61043 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NinQ61043 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NinQ61043 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NinQ61043 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NinQ61043 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NinQ61043 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NinQ61043 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NinQ61043 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NinQ61043 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NinQ61043 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NinQ61043 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NinQ61043 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NinQ61043 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NinQ61043 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NinQ61043 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NinQ61043 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NinQ61043 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NinQ61043 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NinQ61043 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NinQ61043 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NinQ61043 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NinQ61043 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NinQ61043 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NinQ61043 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NinQ61043 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NinQ61043 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NinQ61043 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NinQ61043 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NinQ61043 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NinQ61043 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NinQ61043 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NinQ61043 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NinQ61043 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NinQ61043 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NinQ61043 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NinQ61043 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NinQ61043 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NinQ61043 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NinQ61043 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NinQ61043 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NinQ61043 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NinQ61043 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NinQ61043 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NinQ61043 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NinQ61043 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NinQ61043 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NinQ61043 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NinQ61043 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NinQ61043 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NinQ61043 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NinQ61043 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NinQ61043 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NinQ61043 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NinQ61043 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NinQ61043 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NinQ61043 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NinQ61043 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NinQ61043 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NinQ61043 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NinQ61043 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NinQ61043 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NinQ61043 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NinQ61043 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NinQ61043 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NinQ61043 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NinQ61043 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NinQ61043 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NinQ61043 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NinQ61043 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NinQ61043 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NinQ61043 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NinQ61043 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NinQ61043 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NinQ61043 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NinQ61043 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NinQ61043 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NinQ61043 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NinQ61043 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NinQ61043 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NinQ61043 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NinQ61043 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NinQ61043 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms